部门整体绩效评价，是指财政部门和各部门各单位根据设置的绩效目标，运用科学、合理的绩效评价指标、评价标准和评价方法，包括部门收入和部门支出在内的预算资金管理为主线，统筹考虑资产和业务活动，从运行成本、管理效率、履职效能、社会效应、可持续发展能力和服务对象满意度等内容进行客观、公正的评价。通过制定恰当、详细的衡量标准衡量部门和单位整体及核心业务实施效果。与基本支出和项目支出绩效评价相比，部门整体绩效评价难度更大，如何进行目标的编制是一个亟需解决的重要问题。